bionemo-framework/tach.toml at main · NVIDIA/bionemo-framework · GitHub

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
interfaces = []
exclude = [
    "**/*__pycache__",
    "**/*egg-info",
    "LICENSE",
    "build",
    "docs",
    "tests",
    "venv",
]
source_roots = [
    "sub-packages/bionemo-core/src",
    "sub-packages/bionemo-moco/src",
    "sub-packages/bionemo-noodles/src",
    "sub-packages/bionemo-recipeutils/src",
    "sub-packages/bionemo-scdl/src",
    "sub-packages/bionemo-scspeedtest/src",
    "sub-packages/bionemo-size-aware-batching/src",
    "sub-packages/bionemo-webdatamodule/src",
]

[[modules]]
path = "bionemo.core"
depends_on = []

[[modules]]
path = "bionemo.moco"
depends_on = []

[[modules]]
path = "bionemo.noodles"
depends_on = [
    "bionemo.core",
]

[[modules]]
path = "bionemo.recipeutils"
depends_on = [
    "bionemo.core",
]

[[modules]]
path = "bionemo.scdl"
depends_on = [
    "bionemo.core",
]

[[modules]]
path = "bionemo.scspeedtest"
depends_on = [
    "bionemo.core",
    "bionemo.scdl",
]

[[modules]]
path = "bionemo.size_aware_batching"
depends_on = [
    "bionemo.core",
]

[[modules]]
path = "bionemo.webdatamodule"
depends_on = [
    "bionemo.core",
]